Atualmente, o município de Boqueirão do Leão é governado por João Davi Goergen, do Partido dos Trabalhadores (PT), com o suporte de seu vice-prefeito, Joel André Conte.
A Administração Municipal é o órgão centralizador dos principais assuntos que envolvem a comunidade, bem como coordenador do trabalho de todas as Unidades Administrativas.
